Foto: Shutterstock

Unikátní mikrobiální „otisk prstu“ rakoviny tlustého střeva

Rakovina tlustého střeva může mít unikátní mikrobiální „otisk prstu“, který ji odlišuje od jiných typů rakoviny a otevírá nové možnosti v diagnostice a léčbě. Výzkumníci z University of East Anglia zjistili, že pouze nádory tlustého střeva konzistentně hostí odlišné mikrobiální komunity, což zpochybňuje dlouholetou víru, že všechny rakoviny mají své vlastní mikrobiální podpisy.

Autor původního článku: redakce

Výzkum a jeho význam

Rakovina tlustého střeva je čtvrtou nejčastější rakovinou ve Velké Británii a druhou nejčastější příčinou úmrtí souvisejících s rakovinou. Nové poznatky mohou pomoci lékařům lépe pochopit, jak se nemoc vyvíjí, jak agresivní může být a jak pacienti mohou reagovat na různé léčby. Tým analyzoval data celogenomového sekvenování od více než 9 000 pacientů s rakovinou. Jejich výsledky, publikované v časopise Science Translational Medicine, také zpochybňují široce rozšířený předpoklad, že každý typ rakoviny má svůj vlastní unikátní mikrobiální podpis.

Analýza mikrobiálních komunit v nádorech

Pro provedení studie výzkumníci zkoumali data sekvencí DNA z Genomics England z 11 735 vzorků rakoviny pokrývajících 22 různých typů rakoviny. „Když sbíráte sekvence DNA rakoviny, získáváte také informace z DNA mikrobů obsažených ve vzorcích,“ řekl Dr. Abraham Gihawi z Norwich Medical School UEA. „Chtěli jsme určit přesné složení DNA mikrobů přítomných v každém vzorku. Vyvinuli jsme počítačové programy k odstranění lidské DNA a analýze zbývající DNA mikrobů.“

Výsledky a jejich klinické využití

Analýza odhalila jasný vzorec. Mezi všemi zkoumanými rakovinami pouze nádory tlustého střeva konzistentně vykazovaly unikátní a identifikovatelnou mikrobiální komunitu. „Naše výsledky ukazují, že pouze nádory tlustého střeva mají jednoznačně identifikovatelné mikrobiální komunity. Doufáme, že to může pomoci lékařům přesněji diagnostikovat nemoc a výzkumníkům studovat mikroby nalezené v rakovině tlustého střeva,“ dodal Dr. Gihawi.

Studie také naznačuje širší klinické využití. U orálních rakovin výzkumníci zjistili, že určité viry, jako je HPV (lidský papilomavirus), mohou být detekovány přesněji než některými současnými diagnostickými testy. Také identifikovali vzácné, ale nebezpečné viry, včetně Human T-Lymphotropic Virus-1 (HTLV-1), které mohou zůstat v těle nečinné a později přispět k rozvoji rakoviny.

Vliv mikroorganismů na přežití a léčbu

Nálezy naznačují, že mikroby mohou dělat více než jen existovat vedle rakoviny. V některých případech se zdají být spojeny s tím, jak se pacientům daří. „Zjistili jsme, že určité typy bakterií byly spojeny s horšími přežitími v některých případech sarkomu. To by mohlo vést k dalšímu výzkumu a možnostem léčby těchto typů rakoviny,“ řekl Dr. Gihawi.

Význam celogenomového sekvenování

Odborníci tvrdí, že práce zdůrazňuje rostoucí význam sekvenování genomu v moderní medicíně. Profesor Daniel Brewer z Norwich Medical School UEA uvedl: „Tato studie zdůrazňuje rostoucí klinickou hodnotu celogenomového sekvenování při identifikaci patogenních organismů, jako je HTLV-1 a papilomavirus, které by jinak mohly zůstat neodhaleny.“

Spolupráce a financování

Projekt vedla UEA a zapojil výzkumníky z několika institucí, včetně University of Leeds, Quadram Institute, Oxford Nanopore Technologies, Institute of Cancer Research v Londýně, University of Manchester, National Institute for Health and Care Research (NIHR) Manchester Biomedical Research Centre, University of Athens (Řecko), University of Liverpool, Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust, University College London, University of Southampton, University of North Carolina (USA) a Earlham Institute. Financování studie poskytly Big C Cancer Charity a Prostate Cancer UK.